حضرت آیت الله خامنه ای، رهبر معظم انقلاب اسلامی روز 28 اسفند 78 در نامه ای خطاب به رئیس جمهور ، با ابراز نگرانی از آینده ی امنیت کشور، ضمن اشاره به روند کند پیگیری پرونده قتلهای زنجیره ای، بر رسیدگی جدی به پرونده ی اتفاقات اخیر، در مدت معینی تأکید فرمودند.
متن نامه ی رهبر انقلاب بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
جناب آقای خاتمی ریاست محترم جمهور و رئیس شورای عالی امنیت ملی
با سلام و تحیت حادثه ی ترور هفته قبل و برخی قضایای پیرامونی تا امروز، موجب نگرانی اینجانب از آینده ی امنیت کشور است و از آنرو شایسته است که جنابعالی به دستگاههای مسؤول همچون وزارتهای اطلاعات و کشور و شورای امنیت کشور دستور فرمائید با سرعت و جدیت بیشتری در جستجوی کشف و تعقیب عوامل جنایت باشند.
بیم آن هست که این قضیه نیز مانند پرونده ی قتلهای زنجیره یی دامنه دار و تبدیل به موضوعی مبهم و شایعه انگیز گردد.
در موضوع قتلها با این که جنابعالی هیئتهایی را پی در پی مسؤول پیگیری کردید، تمام نشدن موضوع، موجب بروز شایعات و ایجاد فضای تردید و ابهام شد، در این قضیه نیز مشاهده می شود که متأسفانه برخی زبانها و قلمها بشدت سرگرم التهاب آفرینی و شایعه پردازی اند . بی تعهدی را به آنجا رسانده اند که علاوه بر نام آوردن از افراد و اشخاص، با اتهامهای بی دلیل، حتی سازمانهای مسؤول و مورد اعتماد و حتی سپاه و بسیج یعنی مطمئن ترین حافظ امنیت ملی را زیر سؤال برده اند.
در چنین فضای آشفته یی کدام دستگاه قضایی و امنیت می تواند با دقت و تسلط بر اعصاب ، به مسؤولیت خود قیام کند؟ این جوسازی و غوغاگری موجب آن است که عناصر جنایتکار با خیال راحت بتوانند از چشم قانون پنهان بمانند و به همین خاطر اینجانب نسبت به اظهارات کسانی که به این جو دامن می زنند خوشبین نیستم.
شایسته است مسؤولان یاد شده را موظف فرمائید که در مدت معینی به نتیجه ی قانع کننده یی در پرونده ی حادثه برسند، در این صورت نگرانی و دغدغه ی اینجانب کاهش خواهد یافت.
والسلام علیکم و رحمة الله
سید علی خامنه ای
28/12/78