در پي ارتحال مرجع تقليد شيعيان حضرت آيت‌الله العظمي آقاي حاج سيدمحمدرضا گلپايگاني ، از سوي حضرت آيت‌الله خامنه‌اي رهبر معظم انقلاب اسلامي پيام تسليتي به اين شرح صادر شد:
بسم‌الله‌الرحمن‌الرحيم
انالله و انااليه راجعون
با تأسف و اندوه فراوان، خبر مصيبت بار فقداني بزرگ و جبران‌ناپذير را دريافت كردم. عالم بزرگ، فقيه نام آور، مرجع
عظيم‌الشأن، عبد صالح و تقي نقي زكي، آيت‌الله‌العظمي آقاي حاج سيد محمدرضا گلپايگاني قدس‌ا نفسه واعلي ا مقامه، دار فاني را وداع كردند و پس از عمري مشحون از حسنات با نامه عملي سرشار از خيرات و مبرات، دعوت معبود را لبيك گفته به پيشگاه محاسبه الهي شتافتند.
اينجانب با قلبي متالم و با تضرع و ابتهال از حضرت حق جلت عظمته مسئلت مي‌كنم كه اين ميهمان نيكوكار و مطيع را با سلام قولا من رب رحيم، استقبال و ضيافت فرموده ،به مرتبه والاي لقاءلله نائل فرمايد و بهترين پاداش صالحان را به وي ارزاني دارد. اين شخصيت والاي علمي كهنسال، در ميان مراجع عظام تقليد، يكي از موفق‌ترين و سعادتمندترين‌ها بودند. سي‌ودوسال مرجع تقليد، حدود هفتادسال مدرس حوزه علميه قم و حدود هشتادوپنج‌سال سرگرم فراگرفتن و آموختن فقه آل‌محمد عليهم‌السلام بودند.
اولين مدرسه علوم ديني به سبك جديد را ايشان در قم تأسيس كردند. اولين موسسه بزرگ قرآني را ايشان در قم بنيان نهادند. اولين فهرست بزرگ فقهي و حديثي با اتفاده از دانش و اختراعات جديد بشري را ايشان پديد آوردند. صدها مدرسه و مسجد و مؤسسه تبليغ دين در سراسر كشور و در كشورهاي ديگر بنياد كردند هزاران شاگرد را از فقه پخته و عميق خود بهره‌مند ساختند، بسياري آراء و نظرات فقهي كه حاكي از روشن بيني و ذهن نوگراي ايشان بود ارائه كردند و بالاتر از همه با منش و رفتار پرهيزكارانه و با طهارت و تقوايي كه مي‌توانست براي علما و فقها، الگويي زنده و ملموس باشد، عمري پربركت را به و نزاهت كامل گذرانيدند.
آن بزرگوار يكي از اسطوانه‌هاي انقلاب و نظام جمهوري اسلامي بشمار مي‌آمد. در دوران اختناق و در مقابله با حوادث سهمگين سالهاي تبعيد امام‌خميني قدس سره مواردي پيش آمد كه صداي اين مرد بزرگ، تنها صداي تهديد كننده‌اي بود كه از حوزه علميه قم برخاست; و به نهضت شور و توان بخشيد. پس از پيروزي انقلاب، همواره در قضاياي عمومي كشور، حضوري بارز و پشتيباني‌اي صريح از نظام جمهوري اسلامي و از مقام منيع رهبري و شخص شخيص امام راحل قدس‌الله نفسه الزكيه داشت و مورد تكريم و احترام بليغ آن حضرت بود. فقدان اين بقيه السلف اعاظم، و اين ملجاء و مرجعه مؤمنان ،ثلمه‌اي بزرگ و ضايعه‌اي جبران‌ناپذير است .
اينجانب مصيبت اين فقدان تأسف بار را به پيشگاه حضرت بقيه‌الله‌الاعظم ارواحنافداه و به علماي عظام و مراجع تقليد و حوزه‌هاي علميه و به عموم شيعيان و علاقمندان و مقلدان ايشان و بخصوص به بيت شريف و منيع و آقازادگان محترم ايشان تسليت مي‌گويم. و در اين شب جمعه و شب رحمت، لطف و تفضل و غفران الهي را براي ايشان مسئلت مي‌نمايم.
سيد علي خامنه‌اي
24 جمادي الثاني 1414 برابربا 18 آذرماه 1372
بسم‌الله‌الرحمن‌الرحيم
انالله و انااليه راجعون
با تأسف و اندوه فراوان، خبر مصيبت بار فقداني بزرگ و جبران‌ناپذير را دريافت كردم. عالم بزرگ، فقيه نام آور، مرجع
عظيم‌الشأن، عبد صالح و تقي نقي زكي، آيت‌الله‌العظمي آقاي حاج سيد محمدرضا گلپايگاني قدس‌ا نفسه واعلي ا مقامه، دار فاني را وداع كردند و پس از عمري مشحون از حسنات با نامه عملي سرشار از خيرات و مبرات، دعوت معبود را لبيك گفته به پيشگاه محاسبه الهي شتافتند.
اينجانب با قلبي متالم و با تضرع و ابتهال از حضرت حق جلت عظمته مسئلت مي‌كنم كه اين ميهمان نيكوكار و مطيع را با سلام قولا من رب رحيم، استقبال و ضيافت فرموده ،به مرتبه والاي لقاءلله نائل فرمايد و بهترين پاداش صالحان را به وي ارزاني دارد. اين شخصيت والاي علمي كهنسال، در ميان مراجع عظام تقليد، يكي از موفق‌ترين و سعادتمندترين‌ها بودند. سي‌ودوسال مرجع تقليد، حدود هفتادسال مدرس حوزه علميه قم و حدود هشتادوپنج‌سال سرگرم فراگرفتن و آموختن فقه آل‌محمد عليهم‌السلام بودند.
اولين مدرسه علوم ديني به سبك جديد را ايشان در قم تأسيس كردند. اولين موسسه بزرگ قرآني را ايشان در قم بنيان نهادند. اولين فهرست بزرگ فقهي و حديثي با اتفاده از دانش و اختراعات جديد بشري را ايشان پديد آوردند. صدها مدرسه و مسجد و مؤسسه تبليغ دين در سراسر كشور و در كشورهاي ديگر بنياد كردند هزاران شاگرد را از فقه پخته و عميق خود بهره‌مند ساختند، بسياري آراء و نظرات فقهي كه حاكي از روشن بيني و ذهن نوگراي ايشان بود ارائه كردند و بالاتر از همه با منش و رفتار پرهيزكارانه و با طهارت و تقوايي كه مي‌توانست براي علما و فقها، الگويي زنده و ملموس باشد، عمري پربركت را به و نزاهت كامل گذرانيدند.
آن بزرگوار يكي از اسطوانه‌هاي انقلاب و نظام جمهوري اسلامي بشمار مي‌آمد. در دوران اختناق و در مقابله با حوادث سهمگين سالهاي تبعيد امام‌خميني قدس سره مواردي پيش آمد كه صداي اين مرد بزرگ، تنها صداي تهديد كننده‌اي بود كه از حوزه علميه قم برخاست; و به نهضت شور و توان بخشيد. پس از پيروزي انقلاب، همواره در قضاياي عمومي كشور، حضوري بارز و پشتيباني‌اي صريح از نظام جمهوري اسلامي و از مقام منيع رهبري و شخص شخيص امام راحل قدس‌الله نفسه الزكيه داشت و مورد تكريم و احترام بليغ آن حضرت بود. فقدان اين بقيه السلف اعاظم، و اين ملجاء و مرجعه مؤمنان ،ثلمه‌اي بزرگ و ضايعه‌اي جبران‌ناپذير است .
اينجانب مصيبت اين فقدان تأسف بار را به پيشگاه حضرت بقيه‌الله‌الاعظم ارواحنافداه و به علماي عظام و مراجع تقليد و حوزه‌هاي علميه و به عموم شيعيان و علاقمندان و مقلدان ايشان و بخصوص به بيت شريف و منيع و آقازادگان محترم ايشان تسليت مي‌گويم. و در اين شب جمعه و شب رحمت، لطف و تفضل و غفران الهي را براي ايشان مسئلت مي‌نمايم.
سيد علي خامنه‌اي
24 جمادي الثاني 1414 برابربا 18 آذرماه 1372