در پي درگذشت عالم خدوم مرحوم آيت‌الله سيدمهدي يثربي حضرت آيت‌الله خامنه‌اي رهبر معظم انقلاب اسلامي پيام تسليتي صادر كردند.
متن پيام مقام معظم رهبري به اين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
با تأسف و تأثر درگذشت عالم خدوم و بزرگوار مرحوم آيت الله آقاي حاجي سيدمهدي يثربي رحمت الله عليه را به علماء اعلام و حوزه‌هاي علميه و مردم شريف و مومن كاشان، و نيز به بيت محترم و بازماندگان مخصوصا آقازادگان مكرم آن مرحوم تسليت مي‌گويم.
ايشان از جمله علما و روحانيون خدمتگذار و دلسوزي بودند كه از ساليان دور و به ويژه در دوران انقلاب و دفاع مقدس و پس از آن منشأ بركات و خدمات فراواني گرديدند و براي مردم و حوزه هاي علميه پدري مهربان و ناصحي مشفق و راهنمايي خبير محسوب مي‌شدند. خداوند روح ايشان را مشمول رحمت و مغفرت قرار داده با اجداد طاهرينشان محشور فرمايد.
سيدعلي خامنه‌اي
10/مهر ماه/1385
متن پيام مقام معظم رهبري به اين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
با تأسف و تأثر درگذشت عالم خدوم و بزرگوار مرحوم آيت الله آقاي حاجي سيدمهدي يثربي رحمت الله عليه را به علماء اعلام و حوزه‌هاي علميه و مردم شريف و مومن كاشان، و نيز به بيت محترم و بازماندگان مخصوصا آقازادگان مكرم آن مرحوم تسليت مي‌گويم.
ايشان از جمله علما و روحانيون خدمتگذار و دلسوزي بودند كه از ساليان دور و به ويژه در دوران انقلاب و دفاع مقدس و پس از آن منشأ بركات و خدمات فراواني گرديدند و براي مردم و حوزه هاي علميه پدري مهربان و ناصحي مشفق و راهنمايي خبير محسوب مي‌شدند. خداوند روح ايشان را مشمول رحمت و مغفرت قرار داده با اجداد طاهرينشان محشور فرمايد.
سيدعلي خامنه‌اي
10/مهر ماه/1385