رهبر معظم انقلاب اسلامي حضرت آيت الله خامنه اي در پيامي درگذشت روحاني خدوم و بزرگوار مرحوم حجت الاسلام آقاي حاج شيخ محمد جعفر ثمري رحمة الله عليه را تسليت گفتند.
متن پيام به اين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
در گذشت روحاني خدوم و بزرگوار مرحوم حجة الاسلام آقاي حاج شيخ محمد جعفر ثمري رحمة الله عليه را به خاندان محترم و دوستان و ارادتمندان ايشان و به عموم مردم عزيز شهريار تسليت مي‌گويم. اين عالم خدمتگزار و ابوالشهيد در طي ساليان متمادي خدمات با ارزشي به مردم مؤمن آن سامان انجام داده و اميد است اين تلاش ها مأجور و مقبول حضرت احديت باشد. رحمت و غفران الهي بر آن مرحوم باد.
والسلام عليكم و رحمة الله


سيد علي خامنه اي
9/3/1384