حضرت آيت‌الله خامنه‌اي رهبر معظم انقلاب اسلامي در پيامي به شركت كنندگان در نشست ساليانه انجمن‌هاي اسلامي دانشجويان مستقل دانشگاههاي سراسر كشور، با تأكيد بر اينكه محيط دانشگاه امروز نيز نيازمند مشعل‌داران ايمان و تقوا و خودآگاهي سياسي و تحرك و جوشش آرمانگراي دانشجويي است، همه دلسوزان بخصوص دانشجويان را به بيداري و حساسيت روزافزون در برابر فتنه‌هاي فرهنگي و سياسي فراخواندند.
متن پيام مقام معظم رهبري كه حجت‌الاسلام والمسلمين قمي مسؤول نهاد نمايندگي ولي‌فقيه در دانشگاهها آن را قرائت كرد به اين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
جوانان و دانشجويان عزيز
نهال انجمن اسلامي در دانشگاههاي كشور با درايت و دورنگري امام بزرگوار در حساسترين لحظات انقلاب ريشه دوانيد و به ثمر رسيد، و در طول سالهاي متمادي با توصيه‌هاي حكيمانه‌ي آن بزرگوار آبياري شد. امروز با گذشت بيش از دو دهه از آن دوران، ارزش اين نهال انقلابي و اسلامي و مردمي، همچنان برجاست. امروز هم مانند دوران پيدايش اين انجمن‌ها محيط دانشگاه نيازمند مشعل‌داران ايمان و تقوا و خودآگاهي سياسي و تحرك و جوشش آرمانگراي دانشجويي است و انجمن‌هاي اسلامي مي‌توانند در شمار مجموعه‌هاي موفق اين مسؤوليت بزرگ باشند. پرچم عدالت و آزادي اسلامي كه امروز بوسيله‌ي نظام مقدس جمهوري اسلامي در برابر چشم جهانيان برافراشته شده است با دشمنان كينه‌ورز و معاندي روبرو است و زر و زورسالاران بين‌المللي، براي برگرداندن چشم و دل ملت‌هاي مسلمان از اين نشانه‌ي عزت و آزادگي به صدها شيوه و توطئه سرگرمند. نسل جوان و دانشجوي ما بايد لحظه‌اي از اين عرصه‌ي رويارويي و ستيزه‌گري غافل نماند. دست پنهان و آشكار دشمن، دانشگاهها را از جمله‌ي اولين آماج‌هاي توطئه مي‌شمرد و اين، همه‌ي دلسوزان بخصوص خود دانشجويان عزيز را به بيداري و حساسيت روزافزون فرا مي‌خواند. نشانه‌ي فتنه‌هاي فرهنگي و سياسي در برابر چشم همگان است. جوانان با ايمان و آگاه مي‌توانند اين فتنه‌ها را در نطفه خفه كنند و اگر غبار فتنه بر پا شود آنرا فروبنشانند. امام بزرگوار انجمن‌هاي اسلامي را بارها از نفوذ دشمنان برحذر مي‌داشتند. اين توصيه‌ي حكيمانه امروز نيز همچنان باقي است.
اعضاي انجمن‌ها، تلاش سياسي را بايد با خودسازي دروني و معنوي همراه كنند و سد مستحكمي در برابر نفوذ شيطان بسازند. در اين صورت خلوص و صفاي جواني و دل‌پاك و آرمانگراي دانشجويي خود عهده‌دار همه‌ي مسؤوليت‌هاي بزرگ اين دوران خواهد شد.
والسلام عليكم و رحمه الله و بركاته
سيد علي خامنه‌اي
22/05/1381
متن پيام مقام معظم رهبري كه حجت‌الاسلام والمسلمين قمي مسؤول نهاد نمايندگي ولي‌فقيه در دانشگاهها آن را قرائت كرد به اين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
جوانان و دانشجويان عزيز
نهال انجمن اسلامي در دانشگاههاي كشور با درايت و دورنگري امام بزرگوار در حساسترين لحظات انقلاب ريشه دوانيد و به ثمر رسيد، و در طول سالهاي متمادي با توصيه‌هاي حكيمانه‌ي آن بزرگوار آبياري شد. امروز با گذشت بيش از دو دهه از آن دوران، ارزش اين نهال انقلابي و اسلامي و مردمي، همچنان برجاست. امروز هم مانند دوران پيدايش اين انجمن‌ها محيط دانشگاه نيازمند مشعل‌داران ايمان و تقوا و خودآگاهي سياسي و تحرك و جوشش آرمانگراي دانشجويي است و انجمن‌هاي اسلامي مي‌توانند در شمار مجموعه‌هاي موفق اين مسؤوليت بزرگ باشند. پرچم عدالت و آزادي اسلامي كه امروز بوسيله‌ي نظام مقدس جمهوري اسلامي در برابر چشم جهانيان برافراشته شده است با دشمنان كينه‌ورز و معاندي روبرو است و زر و زورسالاران بين‌المللي، براي برگرداندن چشم و دل ملت‌هاي مسلمان از اين نشانه‌ي عزت و آزادگي به صدها شيوه و توطئه سرگرمند. نسل جوان و دانشجوي ما بايد لحظه‌اي از اين عرصه‌ي رويارويي و ستيزه‌گري غافل نماند. دست پنهان و آشكار دشمن، دانشگاهها را از جمله‌ي اولين آماج‌هاي توطئه مي‌شمرد و اين، همه‌ي دلسوزان بخصوص خود دانشجويان عزيز را به بيداري و حساسيت روزافزون فرا مي‌خواند. نشانه‌ي فتنه‌هاي فرهنگي و سياسي در برابر چشم همگان است. جوانان با ايمان و آگاه مي‌توانند اين فتنه‌ها را در نطفه خفه كنند و اگر غبار فتنه بر پا شود آنرا فروبنشانند. امام بزرگوار انجمن‌هاي اسلامي را بارها از نفوذ دشمنان برحذر مي‌داشتند. اين توصيه‌ي حكيمانه امروز نيز همچنان باقي است.
اعضاي انجمن‌ها، تلاش سياسي را بايد با خودسازي دروني و معنوي همراه كنند و سد مستحكمي در برابر نفوذ شيطان بسازند. در اين صورت خلوص و صفاي جواني و دل‌پاك و آرمانگراي دانشجويي خود عهده‌دار همه‌ي مسؤوليت‌هاي بزرگ اين دوران خواهد شد.
والسلام عليكم و رحمه الله و بركاته
سيد علي خامنه‌اي
22/05/1381