در پي ارتحال حجت‌الاسلام آقاي حسيني شاهرودي نماينده مجلس شوراي اسلامي پيام تسليتي از سوي حضرت آيت‌الله خامنه‌اي رهبر معظم انقلاب اسلامي انتشار يافت.
متن پيام بدين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
انا لله و انا اليه راجعون
درگذشت تأسف‌انگيز خدمتگذار با صفا و فداكار اسلام و مسلمين حجت‌الاسلام آقاي حسيني شاهرودي مايه‌ي تأثر و اندوه اينجانب گرديد. اين روحاني فاصل و پرتلاش عمر كوتاه خود را در سنگرهاي حساس دفاع از نظام اسلامي و خدمت به مسلمين و ملت عزيز سپري كرد و همواره عضوي مؤثر و كارآمد از مجموعه‌ي كارگزاران كشور به شمار مي‌آمد و شايد به همين جهت هم بود كه دشمنان مستكبر از او ناخشنود و نسبت به او حساس و عنود بودند و او بي‌اعتنا به تلاش و ترفند دشمنان زندگي خود را با تلاش و مجاهدت سپري مي‌كرد. و سر انجام پس از سفر به كشور آمريكا كه براي شركت در اجلاس بانك جهاني در ميان هيئتي از جمهوري اسلامي بدانجا رفته بود و به دنبال برخورد غيرمعمول و بشدت خصومت‌آميز مأموران آمريكايي با وي و رفتار شبهه‌انگيزي كه در مدت چندين ساعت بازداشت غير قانوني در آن كشور با وي شد، پس از مراجعت به بيماري مهلكي دچار گرديد و متأسفانه جان بر سر خدمت گذاشت و سر انجام به لقاءالله پيوست.
اينجانب با تأسف و اندوه، اين فقدان تلخ را به حضرت ولي الله الاعظم روحي فداه و به ملت ايران بخصوص مردم عزيز شاهرود و بويژه جامعه‌ي علمي معتبر آن شهرستان و به علما محترم و طلاب شاهرودي در همه جاي كشور تسليت مي‌گويم و براي بازماندگان و خانواده داغدار آن مرحوم صبر جزيل و اجر جميل مسألت مي‌نمايم.
سيد علي خامنه‌اي
متن پيام بدين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
انا لله و انا اليه راجعون
درگذشت تأسف‌انگيز خدمتگذار با صفا و فداكار اسلام و مسلمين حجت‌الاسلام آقاي حسيني شاهرودي مايه‌ي تأثر و اندوه اينجانب گرديد. اين روحاني فاصل و پرتلاش عمر كوتاه خود را در سنگرهاي حساس دفاع از نظام اسلامي و خدمت به مسلمين و ملت عزيز سپري كرد و همواره عضوي مؤثر و كارآمد از مجموعه‌ي كارگزاران كشور به شمار مي‌آمد و شايد به همين جهت هم بود كه دشمنان مستكبر از او ناخشنود و نسبت به او حساس و عنود بودند و او بي‌اعتنا به تلاش و ترفند دشمنان زندگي خود را با تلاش و مجاهدت سپري مي‌كرد. و سر انجام پس از سفر به كشور آمريكا كه براي شركت در اجلاس بانك جهاني در ميان هيئتي از جمهوري اسلامي بدانجا رفته بود و به دنبال برخورد غيرمعمول و بشدت خصومت‌آميز مأموران آمريكايي با وي و رفتار شبهه‌انگيزي كه در مدت چندين ساعت بازداشت غير قانوني در آن كشور با وي شد، پس از مراجعت به بيماري مهلكي دچار گرديد و متأسفانه جان بر سر خدمت گذاشت و سر انجام به لقاءالله پيوست.
اينجانب با تأسف و اندوه، اين فقدان تلخ را به حضرت ولي الله الاعظم روحي فداه و به ملت ايران بخصوص مردم عزيز شاهرود و بويژه جامعه‌ي علمي معتبر آن شهرستان و به علما محترم و طلاب شاهرودي در همه جاي كشور تسليت مي‌گويم و براي بازماندگان و خانواده داغدار آن مرحوم صبر جزيل و اجر جميل مسألت مي‌نمايم.
سيد علي خامنه‌اي