به مناسبت درگذشت مرحوم آيت الله آقاي حاج مجتبي عراقي، مقام معظم رهبري پيام تسليتي خطاب به حجةالاسلام حاج شيخ محمود عراقي صادر فرمودند. متن پيام رهبر معظم انقلاب اسلامي به اين شرح است.

بسم الله الرحمن الرحيم
جناب حجة الاسلام آقاي حاج شيخ محمود عراقي دامت تأييداته
درگذشت عم بزرگوارتان مرحوم آيت الله آقاي حاج مجتبي عراقي رحمةالله عليه را به جنابعالي و فرزندان و بازماندگان و بيت محترم محمدي عراقي تسليت عرض مي‎كنم. اين عالم خدوم و پر تلاش سراسر عمر خود را در خدمت به حوزه‎هاي علميه و علوم اسلامي مصروف نمود و در دوران انقلاب با تقديم شهيدي عزيز در صف ايثارگران انقلاب اسلامي قرار گرفت. ارادت آن مرحوم به امام راحل و توجه امام بزرگوار به ايشان نيز از جمله‎ي سوابق با ارزش اين مرد خدوم است. از خداوند متعال علو درجات ايشان را مسئلت نموده اميدوارم زحمات با ارزش ايشان مشمول قبول الهي قرار گيرد و با اولياي مطهر و معصوم عليهم السلام محشور گردد. انشاء الله
والسلام عليكم و رحمةالله
سيدعلي خامنه‎اي
26/1/1380